گروه هيدروكسيل : كه به صورت R-OH نشان داده مي شود . به دليل دارا بودن يك اتم اكسيژن با الكترونگاتيوي قوي قطبي است .

اگر يك مولكول هيدروكسيل جايگزين يك مولكول هيدروژن در مولكول هيدروكربن شود ، خواص مولكول حاصل به ميزان زيادي تغيير مي كند .به عنوان مثال اتان يك هيدروكربن گازي شكل در دماي اتاق است . اگر يك گروه هيدروكسيل جايگزين يك اتم هيدروژن آن شود ، مولكول حاصل ، اتيل الكل يا اتانول است كه در نوشيدني هاي الكلي يافت مي شود اتانول به دليل بر هم كنش گروههاي قطبي هيدروكسيل در مولكولهاي مجاور ، مقداري چسبتاك بوده و در دماي اتاق مايع است .اتيا الكل بر خلاف اتان ، به دليل بر هم كنش گروههاي قطبي هيدروكسيل با مولكولهاي قطبي آب ، در آب حل مي شود .

گروه كربوكسيل :كه به صورت R-COOH نمايش داده مي شود . در شكل غير يونيزه خود داراي يك اتم كربن است كه با يك پيوند كولان دوگانه به يك اتم اكسيژن وبا يك پيوند كولان ساده به اكسيژن ديگر متصل شده و اين اكسيژن خود با يك اتم هيدروژن پيوند دارد . دو اتم الكترونگاتيو اكسيژن ، در مجاور هم يك حالت به شدت قطبي پيدا مي كنند كه باعث مي شود اتم هيدروژن ، الكترون خود را ترك كند و به صورت يون هيدروژن H+ آزاد شود . كروه كربوكسيل يونيزه شده حاصل ، داراي يك بار منفي است .

گروههاي كربوكسيل داراي خاصيت اسيدي ضعيف هستند و فقط بخشي از مولكول به اين صورت يونيزه مي شود . در نتيجه اين مولكول به يكي از دو صورت آبدوست وجود دارد : يوني يا قطبي . گروه كربوكسيل از اجزاء تشكيل دهنده آمينو اسيد و اسيدهاي چرب است .

'گروه آمينو : اين گروه به صورت R-NH2 نمايش داده مي شود . در شكل غير يونيزه خود داراي يك اتم نيتروژن است كه با پيوند كولان به دو اتم هيدروژن متصل شده است . گروههاي آمينوداراي خاصيت ضعيف بازي هستند زيرا قادر به پذيرش يك يون هيدروژن ( پروتون ) ميباشند . گروه آمينوي يونيزه شده حاصل داراي يك بار مثبت است . گروههاي آمينو از اجزاي سازنده آمينو اسيد ها و اسيد هاي نوكلئيك هستند .

گروه كربونيل : حاوي يك اتم كربن است كه با پيوند دوگانه به اتم اكسيژن متصل شده است . اين پيوند دوگانه به دليل الكترونگاتيوي اكسيژن ، قطبي است . در نتيجه گروه كربونيل ، آبدوست است . موقعيت گروه كربنيل در مولكول تعيين مي كند كه اين مولكول به چه گروهي تعلق دارد . يك آلدئيد داراي يك گروه كربونيل است كه در انتهاي اسكلت كربني قرار گرفته و به صورت R-COH نشان داده مي شود . كتون نيز داراي يك گروه كربنيل داخلي است و به صورت

R-CO-R نمايش داده مي شود . مثالي براي نوع آلدئيدي گلوكز و فرم آلدئيد است و مثالي براي كتون ، فروكتوز و استون ميباشد .

گروه فسفات : كه به صورت R-PO4H2 نمايش داده مي شود ،اسيد ضعيفي است . جذب الكترونها به وسيله اتمهاي اكسيژن ميتواند منجر به آزاد سازي يك يا دو يون هيدروژن شود . اشكال يونيزه شده حاصل ، داراي يك يا دو بار منفي خواهد بود . فسفاتها از اجزاي تشكيل دهنده اسيدهاي نوكلئيك و بعضي ليپيدها (فسفو ليپيدها ) است .

گروه سولفيدريل : به صورت R-SH نشان داده مي شود حاوي يك اتم گوگرد است كه به صورت كولان به يك اتم هيدروژن متصل شده است و در مولكولهايي كه تيول ناميده مي شوند ، يافت مي شوند . آمينو اسيدهايي كه داراي يك گروه سولفيدريل هستند مي توانند نقش مهمي در ساختار پروتئين ها داشته باشند .